卵巢囊肿的治疗方式取决于患者年龄，症状是否恶变，囊肿的部位，体积，大小，生长速度，造成子宫附件的变形情况，是否保留生育功能及患者的主观愿望等因素而定。
现代医学一般采用手术切除囊肿，痛苦大，潜在风险高，费用也高，恢复缓慢，易感染，对工作，学习和生活有一定影响，放疗，化疗易损伤正气及机体正常细胞，使患者免疫功能降低，痛苦较大，费用也大，激素类药物易引起肝，肾等其他脏腑功能正常，也会对药品产生依赖性。对卵巢囊肿的治疗基本上分为保守疗法和开刀抽取疗法。患者不到万不得已最好不开刀治疗卵巢囊肿，一但切除了卵巢输卵管和子宫，对女士的身体生理和精神都有不同程度的影响。卵巢囊肿不要刺激它也不要随便就进行抽取，很多患者反映越抽囊肿长的越快。据不完全统计，一个省级三甲医院每天都有几台卵巢囊肿切除术，全国有多少这类的医院？每年要切掉多少女士的卵巢，子宫？外科手术的确治愈了很多患者，但同时也切出了多少人间悲剧！科学的办法应该是选对药物积极治疗并结合密切随访复查，注意卵巢囊肿的性质变化，再采取相应的对策。
中医中药从整体观入手，对机体的气血，经络，脏腑功能进行全面调理，以达气血，经络之通畅，阴阳之平衡的升降浮沉原理，使正气内存，邪不可干的祛邪外出之功。
中药采用调节内分泌，强增免疫辩证施治的方法，采用 软坚散结、活血化瘀、扶正固本 的治疗原则治疗卵巢囊肿，服药方便，见效快，费用低，愈后基本不复发，达到了治病求本、标本兼治的治疗效果.不开刀治疗卵巢囊肿，在临床上取得了很大的进展，取得了很好的疗效。