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 赵金银 王景林 军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室;

 【摘要】悬浮芯片与固体芯片、荧光定量PCR并列成为核酸序列鉴定中的重要的分子生物学工具,并在病原菌检测方面显示出不同的应用领域。悬浮芯片能同时检测多种病原菌,具有处理多样本能力、使用灵活、低成本等特点,适合对未知样本检测及环境监控,能够在生物安全、公共卫生、工农业生产中发挥重要作用;而固体芯片能耦联成千上百个探针,但由于在多样本处理、成本方面欠缺,因此适合于对重要的未知病原体的鉴定;荧光定量PCR具较好特异性、灵敏度,以及多样本处理能力,但在高通量方面欠缺,适合有目的地检测已知病原体。目前已建立三种基于悬浮芯片的检测方法:多重PCR扩增、通用引物扩增16S/23SrDNA、直接对实际样本杂交检测。多重PCR具较好特异性,但其多重能力还难以满足悬浮芯片的高通量的需要;通用引物具较好灵敏度及扩增多靶分子能力,但也存在交叉反应等缺陷。同时,采用PCR扩增方法,悬浮芯片检测的是PCR产物,不能客观反应实际样本中存在病原菌数量及是否具生命力。直接杂交环境样本尽管避免了PCR的缺陷,但在灵敏度方面非常欠缺。目前,在环境样本处理上,仍然缺乏有效的、高通量、自动化的方法,不能满足PCR与悬浮芯片多样本检测的需要。

 【关键词】 悬浮芯片 病原体 基因芯片 荧光定量PCR

 【基金】国家"863"计划项目(2006AA06Z414) 国家自然科学基金项目(30671824)

 【分类号】R450

 前言悬浮芯片,也成为液态芯片,是上世纪90年代中期由Lu-minex公司将基因芯片技术与流式细胞仪技术结合产生的一种新的生物芯片技术,是一种多重数据获取和分析平台,全名为“多功能多指标同步分析体系”(Flexible Multiple AnalyteProfiling,xMap),也称为Multi-Analyte Suspensi
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  摘要：悬浮芯片与固体芯片、荧光定量PCR并列成为核酸序列鉴定中的重要的分子生物学工具，并在病原菌检测方面显示出不同的应用领域。悬浮芯片能同时检测多种病原菌，具有处理多样本能力、使用灵活、低成本等特点，适合对未知样本检测及环境监控，能够在生物安全、公共卫生、工农业生产中发挥重要作用；而固体芯片能耦联成千上百个探针，但由于在多样本处理、成本方面欠缺，因此适合于对重要的未知病原体的鉴定；荧光定量PCR具较好特异性、灵敏度，以及多样本处理能力，但在高通量方面欠缺，适合有目的地检测已知病原体。目前已建立三种基于悬浮芯片的检测方法：多重PCR扩增、通用引物扩增16S/23S rDNA、直接对实际样本杂交检测。多重PCR具较好特异性，但其多重能力还难以满足悬浮芯片的高通量的需要；通用引物具较好灵敏度及扩增多靶分子能力，但也存在交叉反应等缺陷。同时，采用PCR扩增方法，悬浮芯片检测的是PCR产物，不能客观反应实际样本中存在病原菌数量及是否具生命力。直接杂交环境样本尽管避免了PCR的缺陷，但在灵敏度方面非常欠缺。目前，在环境样本处理上，仍然缺乏有效的、高通量、自动化的方法，不能满足PCR与悬浮芯片多样本检测的需要。

 关键词：悬浮芯片；病原体；基因芯片；荧光定量PCR

 中图分类号：Q939.9，R37 文献标识码：A 文章编号：1673—6273(2009)08—1559—04