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论文下载:基于功能一致性预测冠心病致病基因

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 å‚è§é™„ä»¶(2119KB,4页)。

 å­™ç«‹ä¸­ å¼ è‰¯æ‰ é™ˆä¸½å¨œ 赵研 尚玉奎 王倩 哈尔滨医科大学生物信æ¯ç§‘学与技术学院;

 ã€æ‘˜è¦ã€‘目的:为了解疾病致病机ç†å’Œæ”¹è¿›ä¸´åºŠæ²»ç–—,基于功能一致性挖掘潜在的疾病致病基因。方法:本文基于功能一致性基因的共定ä½ç‰¹æ€§,结åˆè›‹ç™½è´¨äº’作网络拓扑结构,获å–疾病候选基因集,并通过GOåŠKEGGåŠŸèƒ½å¯Œé›†åˆ†æžæ–¹æ³•进一步筛选,预测出新的致病基因。结果:挖掘得到的59个冠心病致病基因通过文献è¯å®žç»å¤§éƒ¨åˆ†åŸºå› ä¸Žç–¾ç—…çš„å‘生å‘展存在ç€è”系。结论:本方法具有å¯è¡Œæ€§,研究者能够在此基础上很好地进行疾病致病机ç†çš„研究。

 ã€å…³é”®è¯ã€‘ 蛋白质互作网络 共定ä½ç‰¹æ€§ åŠŸèƒ½å¯Œé›†åˆ†æž åŠŸèƒ½ä¸€è‡´æ€§

 ã€åŸºé‡‘】国家自然科学基金资助项目(30571034) 黑龙江çœè‡ªç„¶ç§‘学基金项目(D2007-48) 哈尔滨医科大学研究生创新基金(HCXS2008010) 哈尔滨医科大学医学基础学科创新群体基金项目

 ã€åˆ†ç±»å·ã€‘R541.4

 å‰è¨€å¤æ‚疾病被认为是由多个风险基因导致的[1]ã€‚æŒ–æŽ˜ç–¾ç—…è‡´ç—…åŸºå› æœ‰å¤šç§æ–¹æ³•,现有的方法倾å‘于分别利用基因表达谱ã€åŸºå› ç»„层é¢å…³è”分æžã€è›‹ç™½äº’作网络的拓扑性质等æ¥é¢„测致病基因。Schwihouski[2]å’ŒTitz[3]ç­‰æå‡ºè›‹ç™½è´¨åŒå®ƒä»¬çš„直接相互作用邻居之间具有相似的功能。Oti[4]
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  æ‘˜è¦ ç›®çš„ï¼šä¸ºäº†è§£ç–¾ç—…è‡´ç—…æœºç†å’Œæ”¹è¿›ä¸´åºŠæ²»ç–—,基于功能一致性挖掘潜在的痰病致病基因。方法:本文基于功能一致性基因的共定ä½ç‰¹æ€§ï¼Œç»“åˆè›‹ç™½è´¨äº’作网络拓扑结构,获å–疾病候选基因集,并通过GOåŠKEGGåŠŸèƒ½å¯Œé›†åˆ†æžæ–¹æ³•进一步筛选,预测出新的致病基因。结果:挖掘得到的59个冠心病致病基因通过文献è¯å®žç»å¤§éƒ¨åˆ†åŸºå› ä¸Žç–¾ç—…çš„å‘生å‘展存在ç€è”系。结论:本方法具有å¯è¡Œæ€§ï¼Œç ”究者能够在此基础上很好地进行疾病致病机ç†çš„研究。

 å…³é”®è¯ï¼šè›‹ç™½è´¨äº’作网络;共定ä½ç‰¹æ€§ï¼›åŠŸèƒ½å¯Œé›†åˆ†æžï¼›åŠŸèƒ½ä¸€è‡´æ€§

 ä¸­å›¾åˆ†ç±»å·ï¼šR318.04,R541.4 文献标识ç ï¼šB 文章编å·ï¼š1673-6273(2009)04-733-04
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