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CRISPR应用指南:导入DNA、RNA还是蛋白质?[心得点评]

在基因组编辑的世界里,CRISPR/Cas9代表着王牌。它为研究人员带来了一种简单的方法,将核酸酶、转录调控因子或荧光蛋白送到基因组中的任何地址。这种方法已改变了疾病研究、基因调控、药物开发等。


在基因组编辑的世界里,CRISPR/Cas9代表着王牌。它为研究人员带来了一种简单的方法,将核酸酶、转录调控因子或荧光蛋白送到基因组中的任何地址。这种方法已改变了疾病研究、基因调控、药物开发等。

不过,研究人员首先需要将Cas9蛋白和向导RNA(gRNA)导入他们感兴趣的细胞。事实证明,他们有几种选择。

各花入各眼

在CRISPR/Cas9系统中,研究人员可以自由地选择转染DNA表达载体、mRNA和gRNA,或蛋白质。据赛默飞世尔转染部门的研发主管Xavier de Mollerat du Jeu介绍,这具体取决于研究人员需要多少蛋白,以及需要多长时间。

他解释道,DNA表达载体往往在几天内产生高水平表达的蛋白质和RNA,但有延迟,因为基因必须被转录和翻译。对于Cas9 mRNA和gRNA,编辑更快发生,因为不需要转录,但在转录本降解之后会迅速下降。蛋白当然是最快的,因为不需要转录或翻译。与RNA一样,蛋白快速周转。

Bio-Rad的全球产品经理Veronika Kortisova认为,对于Cas9而言,快速周转其实是件好事,因为与长期表达相比脱靶事件更少。“人们认为,当系统进去之后,它开展编辑并离开细胞,这样毒性较低。对于质粒,持续的蛋白表达有时会造成负面影响。”

不过,Mirus Bio的研发负责人Laura Juckem认为,这也有缺点。最明显的是,蛋白和mRNA需要实验室额外的纯化工作,成本也比质粒DNA更高。当然,研究人员也能从一些供应商处购买现成的Cas9蛋白或mRNA,比如GE Healthcare Dharmacon、MilliporeSigma、美天旎、赛默飞世尔和NEB。

转染选择多

研究人员在导入核酸时通常有两种选择:转染试剂和电穿孔。转染试剂大多为脂质体、聚合物等。一些试剂是为特定类型的目标而设计的,比如Bio-Rad的siLentFect适用于siRNA,赛默飞的Lipofectamine MessengerMAX适用于mRNA,而Promega的FuGENE专为DNA而优化。其他的转染试剂,如赛默飞的Lipofectamine 3000和Bio-Rad的TransFectin试剂,则支持更广泛的应用。

电穿孔是在细胞膜上打了一个孔,如果分子能穿过这个缺口,则它就能进入细胞。“在导入CRISPR/Cas9工具时,Nucleofection非常高效,”Lonza的高级产品经理Andrea Toell谈道。Lonza的Nucleofection平台实现了各种细胞的电穿孔,包括难以转染的原代细胞。Toell还表示,Lonza提供了各种立即可用的操作方案,这样客户可立即启动他们的实验,而不需要优化条件。同样地,Bio-Rad的GenePulser Xcell和赛默飞的Neon系统也有类似的数据库。

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