肛肠外科主要是治疗肛门、肛管、直肠和结肠的外科疾病的科室。此外，肛门周围性传播疾病如尖锐湿疣以及各种先天性肛门直肠畸形如先天性肛门闭锁等也属于肛肠外科疾病的范畴。会跟胃肠外科有重叠的诊疗范围，有些医院会把肛肠外科归入到普外科(普通外科)。肛肠外科的疾病属于常见病、多发病，很多虽不致命，但带给病人痛苦、麻烦的程度排在多数疾病之前。