引起习惯性流产的原因比较复杂，而且常为多种因素共同所致。

目前比较明确的病因有：1、遗传因素：约占习惯性流产的4.5%25%，如胚胎染色体的异常，流产多发生在妊娠8周以内。2、内分泌因素：约占13%2%，如卵巢黄体功能不全，亦早期流产的常见原因。3、生殖器官异常：约占12%15%，如子宫发育不良，宫颈内口功能不全症等，多引起晚期流产。4、感染因素：占2%，如病毒或细菌感染，一方面可导致胚胎的发育异常，另一方面可引起生殖器官的炎症，不利于孕卵着床。