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2025-01-03当å‰ä½ç½®ï¼šç½‘站首页 > è¡Œä¸šåŠ¨æ€ > æ•°æ®å…±äº« > 期刊æ‚å¿— >

评估基因芯片法检测è€å¤šè¯ç»“核分离株的临床æ„义

  ã€æ‘˜è¦ã€‘目的:分æžåŸºå› èŠ¯ç‰‡æ³•æ£€æµ‹è€å¤šè¯ç»“核分离株的临床æ„ä¹‰ã€‚æ–¹æ³•ï¼šé‡‡ç”¨åˆ†å±‚æŠ½æ ·æ£€æµ‹æ–¹æ³•ä»Žä¸Šæµ·åŒæµŽå¤§å­¦é™„属上海市肺科医院ã€åŒ—京胸科医院ã€å¹¿å·žå¸‚èƒ¸ç§‘åŒ»é™¢çš„ä¸´åºŠèŒæ ªåº“ä¸­çš„æ•æ„Ÿç»„å’Œè€è¯ç»„ï¼ŒéšæœºæŠ½å–è€è¯æ ªåˆ©ç¦å¹³400株,异烟肼363æ ª.è€å¤š342株,利ç¦å¹³/å¼‚çƒŸèƒ¼åŒæ•感180株。用基因芯片法检测基因的511ã€513ã€516ã€526ã€531ã€533ä½ç‚¹ã€katGçš„315ä½ç‚¹ä»¥åŠinhAçš„-15ä½ç‚¹çš„è€è¯çªå˜ã€‚è®¡ç®—å‡ºåŸºå› ä¸­çš„èŠ¯ç‰‡æ³•çš„ç‰¹å¼‚åº¦ã€æ•感度以åŠç¬¦åˆçŽ‡ã€‚è¿˜è¦å¯¹æ ¸é…¸æ‰©å¢žäº§ç‰©è¿›è¡Œæµ‹åºï¼Œé€šè¿‡éªŒè¯åŸºå› èŠ¯ç‰‡å¯¹æ ¸é…¸åºåˆ—检测的准确性。结果:用ç»å¯¹æµ“åº¦æ³•è¯æ•结果作为标准,基因芯片法检测ç¦å¹³94.6%ã€å¼‚烟肼è€è¯82.7%ã€è€å¤šè¯83.5%ã€‚æ•æ„Ÿåº¦æ£€æµ‹åˆ©ç¦å¹³è€è¯91.0%ã€å¼‚烟肼è€è¯76.3%ã€è€å¤šè¯73.5%。特异度检测利ç¦å¹³è€è¯96.1%ã€å¼‚烟肼è€è¯95.8%ã€è€å¤šè¯97.0%。在利ç¦å¹³åŸºå› èŠ¯ç‰‡æ£€æµ‹ä¸­ï¼Œçªå˜é¢‘率最高的ä½ç‚¹æ˜¯531,çªå˜çŽ‡ä¸º63.4%。在katG/inhAçªå˜èŒæ ªä¸­.基因芯片检测为ktG 315å•çªå˜çš„为76.3%。与测åºç»“果基本一致,有4ä¾‹èŒæ ªä¸­ä¸ç›¸ç¬¦ã€‚其中l株异烟肼è€è¯èŒåŸºå› èŠ¯ç‰‡æ³•æ£€æµ‹ä¸ºkatG 315çªå˜.其测åºç»“果为野生型.å…¶ä½™3株为基因芯片法没有包å«çš„çªå˜ç±»åž‹ã€‚ 结论:基因芯片法能够检测结核临床分离株利ç¦å¹³å’Œå¼‚烟肼的è€è¯æ€§.å¯ä»¥åœ¨ä¸´åºŠè¯Šæ–­ä¸­åº”用。
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 ã€å…³é”®è¯ã€‘结核 æŠ—è¯æ€§ ç»†èŒ åŸºå› èŠ¯ç‰‡ 检测

 ç»“核病是能够å¨èƒå…¬å…±å®‰å…¨çš„传染病之一。全çƒ2008结核病患者有940万,è€å¤šè¯ç»“核病有36万,致死15万[1]ã€‚ç»“æ ¸åˆ†æžæ†èŒä¸­çš„异烟肼和利ç¦å¹³åŒæ—¶è€è¯å°±ä¼šé€ æˆè€å¤šè¯ç»“核病。如果进行传统的è¯ç‰©æ•感性试验诊断结核病,大概需è¦1-3个月,这段时间内病人没有办法进行åˆé€‚的化疗。因此对于病人的早期治疗会有影å“,甚至还å¯èƒ½äº§ç”Ÿæ–°çš„获得性è€è¯ï¼Œè¿›è€Œé€ æˆç»“核病在社区中广泛的传播。所以,研制出能够快速检测异烟肼è€è¯å’Œåˆ©ç¦å¹³çš„实验方法,对于结核病的早期诊断和治疗将会是很大的çªç ´ã€‚

 åœ¨ä»¥å¾€çš„è¿‡ç¨‹ä¸­ï¼Œç»“æ ¸åˆ†æžæ†èŒé’ˆå¯¹åˆ©ç¦å¹³å’Œå¼‚烟肼的è€è¯æ€§å’ŒåŸºå› çªå˜ç›¸å…³ã€‚利ç¦å¹³çš„è€è¯æ€§ä¸ŽrpoB基因å‘生çªå˜æœ‰å…³[2]。异烟肼的è€è¯æ€§ä¸ŽåŸºå› è°ƒèŠ‚æœ‰å…³[3]。以ç»å¯¹æµ“åº¦æ³•çš„è¯æ•结果为标准,评价基因芯片法检测è€å¤šè¯åœ¨ç»“æ ¸ä¸´åºŠåˆ†ç¦»æ ªä¸­æ£€æµ‹çš„æ•æ„Ÿåº¦ã€ç‰¹å¼‚度和符åˆçŽ‡ï¼Œ1资料与方法

 1.1 一般资料
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 é€‰å–ä¸Šæµ·åŒæµŽå¤§å­¦é™„属上海市肺科医院ã€åŒ—京胸科医院ã€å¹¿å·žå¸‚èƒ¸ç§‘åŒ»é™¢çš„ä¸´åºŠèŒæ ªåº“

 ä¸­çš„æ•æ„Ÿç»„å’Œè€è¯ç»„ï¼ŒéšæœºæŠ½å–è€è¯æ ªåˆ©ç¦å¹³800株,异烟肼797æ ª.è€å¤š791株,利ç¦å¹³/å¼‚çƒŸèƒ¼åŒæ•感380株。用基因芯片法检测基因的511ã€513ã€516ã€526ã€531ã€533ä½ç‚¹ã€katGçš„315ä½ç‚¹ä»¥åŠinhAçš„-15ä½ç‚¹çš„è€è¯çªå˜ã€‚è®¡ç®—å‡ºåŸºå› ä¸­çš„èŠ¯ç‰‡æ³•çš„ç‰¹å¼‚åº¦ã€æ•感度以åŠç¬¦åˆçŽ‡ã€‚è¿˜è¦å¯¹æ ¸é…¸æ‰©å¢žäº§ç‰©è¿›è¡Œæµ‹åºï¼Œé€šè¿‡éªŒè¯åŸºå› èŠ¯ç‰‡å¯¹æ ¸é…¸åºåˆ—检测的准确性。

 è´­ä¸­å›½åšå¥¥ç”Ÿç‰©æœ‰é™å…¬å¸çš„ç»“æ ¸åˆ†æžæ†èŒè€è¯æ£€æµ‹èŠ¯ç‰‡åˆ¤åˆ«ç³»ç»Ÿï¼Œè¿˜æœ‰ç»“æ ¸åˆ†æžæ†èŒè€è¯è¯•剂盒以åŠå¾®é˜µåˆ—芯片扫æä»ªã€‚è¯ç‰©æ•感培养基实验室自备,购美国Sigmaå…¬å¸è¯ç²‰ã€‚购美国ABIå…¬å¸9700循环扩增仪。

 1.2 方法

 ä»¥ä¸­å›½å›½å®¶ç»“核病和世界å«ç”Ÿç»„织对比实验室浓度æ¥ä½œä¸ºæ ‡å‡†è¿›è¡Œè¯ç‰©æ•æ„Ÿå®žéªŒï¼Œæ£€æµ‹èŒæ ªè€è¯æ€§ä»¥ç»å¯¹æµ“度法。NaOH4%液化接ç§åˆ°æ”¹è‰¯ç½—æ°åŸ¹å…»åŸºä½œä¸ºç—°æ ‡æœ¬ã€‚å«è¯åŸ¹å…»åŸºæ²¡æœ‰ç”Ÿé•¿å°±æ˜¯æ•感。检测利ç¦å¹³çš„基因rpoB以åŠå¼‚烟肼的基因katGã€inhAçš„çªå˜åž‹åŸºå› ã€‚æå–核酸,备用。用ä¸å¯¹ç§°æ‰©å¢žæ³•扩增基因ä½ç‚¹ã€‚在探针正常情况下,野生型未出现信å·ï¼Œä½†æ˜¯çªå˜åž‹å‡ºçŽ°ä¿¡å·å°±æ˜¯çªå˜åž‹ï¼Œå之就是野生型。如果çªå˜åž‹å’Œé‡Žç”Ÿåž‹å‡æ— ä¿¡å·ï¼ŒèŒç§æœ‰ä¿¡å·ï¼Œæˆ–者çªå˜åž‹å’Œé‡Žç”Ÿåž‹çš„ä¿¡å·æ²¡æœ‰è¾¾åˆ°è½¯ä»¶è¯»å–值时,判定为无结果。以ç»å¯¹æµ“度å‘和基因芯片对比,对于ä¸ç¬¦åˆçš„æ ‡æœ¬åå¤è¿›è¡Œæ£€æµ‹ã€‚
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 PCR扩增产物测åºï¼Œç”±åŒ—京诺赛基因组研究中心有é™å…¬å¸å¤„ç†PCR产物。è§ä¸‹è¡¨ã€‚

 1.3 统计学分æž

 ä»¥ç»å¯¹æµ“åº¦æ³•è¯æ•结果作为标准,计算出基因芯片法的特异度ã€ç¬¦åˆçŽ‡ã€æ•æ„Ÿåº¦ï¼Œæ£€éªŒåŸºå› èŠ¯ç‰‡ç»“æžœå’Œè¯æ•实验是å¦ä¸€è‡´æ€§ï¼ŒP, 百拇医è¯
 è®¨è®º

 å¦‚ä¸Šæ‰€è¯´ï¼Œåˆ†å­æ£€æµ‹æ–¹æ³•在è€è¯ç»“核病的诊断中å—到了很大的é‡è§†ï¼Œåˆ†å­æ£€æµ‹æ³•的特点就是快速准确,为è€è¯ç»“核病的控制产生了希望。本次研究针对基因芯片检测è€å¤šè¯ç»“æ ¸ç—…è¿›è¡Œäº†ä¸´åºŠè¯„ä¼°ï¼Œä½¿å¾—ç»“æ ¸åˆ†æžæ†èŒä¸´åºŠåˆ†ç¦»æ ªèŽ·å¾—äº†ç‰¹å¼‚åº¦ä»¥åŠæ•感度,但是与传统的ç»å¯¹æµ“åº¦æ³•è¯æ•结果ä»ç„¶æœ‰å·®å¼‚。基因芯片法在临床è€è¯ç»“核病的诊断中有éžå¸¸å¹¿é˜”çš„åº”ç”¨å‰æ™¯ï¼Œä½†æ˜¯ä¼ ç»Ÿè¯æ•æ³•ä»æ— æ³•被å–代,将两者结åˆèµ·æ¥æ–¹å¯ä¸ºä¸´åºŠè¯Šæ–­å·¥ä½œæä¾›ä¾æ®ã€‚

 å‚考资料

 [1] Wodd Health Organization.Global Tuberculosis Control a shor:update to the 2009 report.2010.39:233-235

 [2] World Health Organization.Muhidmg and Extensively DnIgresistant TB(MXDR.TB).2010. 15:174-176

 [3] 陈曦,马屿.金奇,ç­‰.è€å¼‚çƒŸè‚¼ç»“æ ¸åˆ†æžæ†èŒç›¸å…³è€è¯åŸºå› DNAåºåˆ—分æž.[J]中åŽç»“æ ¸å’Œå‘¼å¸æ‚å¿—.2011.28:250-253., 百拇医è¯(王慧)
 ç™¾æ‹‡åŒ»è¯ç½‘ http://www.100md.com/html/paper/2095-7432/2014/05/55.htm
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