西藏军区总医院全军高山病中心的前身是1982年批准成立的全军高山病防治研究中心，由高山病实验室和高山病专科病房组成，临床专业包括高原病和呼吸两个专业。2005年3月，西藏军区总医院对全军高山病防治研究中心进行了整合，将全院内科系统的专家整合到中心。2006年，经总后勤部批准，全军高山病防治研究中心更名为全军高山病中心。

 全军高山病中心拥有高原最大的高压氧舱、核磁共振成像系统、肺功能检测仪、运动平板功能仪、血气分析仪、呼吸机、放射免疫检测仪、细胞培养仪、恒温离心机、NO治疗仪、心电监护仪、亚低温治疗仪、超短波治疗仪等价值1300余万元的科研设备；订阅有国内外各种医学期刊52种，建立了信息技术平台，可通过互联网、解放军图书馆查阅最新各种文献；建立了心导管室、运动平板实验室、肺功能实验室、心脏彩超检查室、NO治疗室、抽血室、生化检测室、放射免疫检查室 ......
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